Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1mwO35599 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Opn1mwO35599 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Opn1mwO35599 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Opn1mwO35599 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms