Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Polr1aO35134 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Polr1aO35134 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Polr1aO35134 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Polr1aO35134 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Polr1aO35134 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms