Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ncoa3O09000 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ncoa3O09000 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ncoa3O09000 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ncoa3O09000 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ncoa3O09000 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ncoa3O09000 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ncoa3O09000 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ncoa3O09000 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ncoa3O09000 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ncoa3O09000 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ncoa3O09000 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ncoa3O09000 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ncoa3O09000 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ncoa3O09000 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Ncoa3O09000 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ncoa3O09000 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms