Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20877J3QPZ4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20877J3QPZ4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20877J3QPZ4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Gm20877J3QPZ4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gm20877J3QPZ4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gm20877J3QPZ4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Gm20877J3QPZ4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20877J3QPZ4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Gm20877J3QPZ4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Gm20877J3QPZ4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Gm20877J3QPZ4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Gm20877J3QPZ4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20877J3QPZ4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms