Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20918J3QN17 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20918J3QN17 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20918J3QN17 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms