Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20830J3KML6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20830J3KML6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20830J3KML6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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