Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933406M09RikG3XA12 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933406M09RikG3XA12 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.4 ms