Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3tc1G3X9F6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sh3tc1G3X9F6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3tc1G3X9F6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3tc1G3X9F6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1003 ms