Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LctF8VPT3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LctF8VPT3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LctF8VPT3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LctF8VPT3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LctF8VPT3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LctF8VPT3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LctF8VPT3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LctF8VPT3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LctF8VPT3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms