Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pagr1bF6V0H0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pagr1bF6V0H0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pagr1bF6V0H0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pagr1bF6V0H0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms