Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Erich3F6QRE9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Erich3F6QRE9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Erich3F6QRE9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Erich3F6QRE9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Erich3F6QRE9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Erich3F6QRE9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Erich3F6QRE9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Erich3F6QRE9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Erich3F6QRE9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms