Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ythdc1E9Q5K9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ythdc1E9Q5K9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ythdc1E9Q5K9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdc1E9Q5K9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms