Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Myo5cE9Q1F5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Myo5cE9Q1F5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Myo5cE9Q1F5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Myo5cE9Q1F5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
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