Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Ift140E9PY46 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ift140E9PY46 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.3
Ift140E9PY46 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ift140E9PY46 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ift140E9PY46 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms