Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim30bE9PVL6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim30bE9PVL6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim30bE9PVL6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms