Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttc17E9PVB5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc17E9PVB5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc17E9PVB5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms