Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Syde2E9PUP1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syde2E9PUP1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Syde2E9PUP1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syde2E9PUP1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms