Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ldlrad1D3YYZ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ldlrad1D3YYZ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms