Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms