Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK6

Vmn2r27, Vomeronasal 2, receptor27, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r27D3YUK6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r27D3YUK6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r27D3YUK6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r27D3YUK6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms