Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzd8B9EJ80 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzd8B9EJ80 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzd8B9EJ80 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzd8B9EJ80 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzd8B9EJ80 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzd8B9EJ80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdzd8B9EJ80 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdzd8B9EJ80 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd8B9EJ80 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pdzd8B9EJ80 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms