Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syce3B5KM66 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syce3B5KM66 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syce3B5KM66 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syce3B5KM66 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms