Protein–RNA interactions for Protein: B2RXS4

Plxnb2, Plexin-B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb2B2RXS4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Plxnb2B2RXS4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Plxnb2B2RXS4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Plxnb2B2RXS4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxnb2B2RXS4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms