Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfia1B2RXQ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfia1B2RXQ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfia1B2RXQ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms