Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Clrn2B2RVW2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clrn2B2RVW2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms