Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pde4bB1AWC9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pde4bB1AWC9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pde4bB1AWC9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pde4bB1AWC9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms