Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Supt3B0QZW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Supt3B0QZW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Supt3B0QZW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Supt3B0QZW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt3B0QZW4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Supt3B0QZW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms