Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al2bA9Z055 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2al2bA9Z055 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al2bA9Z055 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms