Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint8A7XV07 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint8A7XV07 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint8A7XV07 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint8A7XV07 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skint8A7XV07 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint8A7XV07 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint8A7XV07 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skint8A7XV07 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skint8A7XV07 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint8A7XV07 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms