Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm3173A6NAS3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3173A6NAS3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms