Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cldn34c4A2ANA3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn34c4A2ANA3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn34c4A2ANA3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms