Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SetxA2AKX3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SetxA2AKX3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SetxA2AKX3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SetxA2AKX3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SetxA2AKX3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SetxA2AKX3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SetxA2AKX3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SetxA2AKX3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SetxA2AKX3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SetxA2AKX3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SetxA2AKX3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 459.6 ms