Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grin3aA2AIR5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin3aA2AIR5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin3aA2AIR5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin3aA2AIR5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin3aA2AIR5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin3aA2AIR5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin3aA2AIR5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms