Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Prdm16A2A935 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Prdm16A2A935 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Prdm16A2A935 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Prdm16A2A935 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Prdm16A2A935 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms