Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WNZ6

1700025B11Rik, RIKEN cDNA 1700025B11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700025B11RikA0A087WNZ6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700025B11RikA0A087WNZ6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700025B11RikA0A087WNZ6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700025B11RikA0A087WNZ6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700025B11RikA0A087WNZ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms