Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav4-2A0A075B638 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav4-2A0A075B638 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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