Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3238W4VSP7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm3238W4VSP7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms