Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms