Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms