Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms