Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn8Q9Z260 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms