Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b1Q9Z1T1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms