Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trpc2Q9R244 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms