Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms