Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AmfrQ9R049 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms