Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a3Q9QZS0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Col4a3Q9QZS0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a3Q9QZS0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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