Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ripk3Q9QZL0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms