Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ercc4Q9QZD4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ercc4Q9QZD4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ercc4Q9QZD4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ercc4Q9QZD4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ercc4Q9QZD4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ercc4Q9QZD4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ercc4Q9QZD4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ercc4Q9QZD4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ercc4Q9QZD4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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