Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Phtf1Q9QZ09 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phtf1Q9QZ09 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms