Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nphp1Q9QY53 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms